Hệ thống điện di gradient nhiệt độ TGGE

Các phương pháp tách điện di truyền thống dựa trên kích thước của phân tử và số lượng điện tích, trong khi TGGE bổ sung một tham số tách mới, cấu hình phân tử. Cấu trúc của phân tử phụ thuộc vào cấu trúc bậc hai và bậc ba của phân tử và bị ảnh hưởng bởi các yếu tố bên ngoài như nhiệt độ, nồng độ muối, độ pH. Cấu trúc ổn định được duy trì bởi liên kết hydro và lực van der Waals, nhiệt độ tăng đến một điểm giới hạn nhất định có thể phá vỡ liên kết hydro và lực van der Waals, các phân tử có dạng ngã ba và tỷ lệ di chuyển giảm rõ rệt, nhiệt độ tại thời điểm này được gọi là nhiệt độ biến tính (Tm). Đối với các phân tử DNA có cùng trọng lượng phân tử, nhiệt độ biến tính (Tm) của chúng thay đổi tùy theo trình tự phân tử. TGGE sử dụng sự khác biệt về giá trị Tm để xác định xem có sự khác biệt trong trình tự phân tử hay không. Điện di TGGE không chỉ tách DNA/RNA mà còn cung cấp dữ liệu về trình tự DNA/RNA hoặc sự ổn định của protein.